EL PAcCTO é coordenado por duas instituições especialistas na gestão de projetos de cooperação: FIIAPP e Expertise France e tem dois sócios europeus: IILA e Camões, I.P.
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A Fundação Internacional e Ibero-americana de Administração e Políticas Públicas (FIIAPP) é uma fundação do setor público do Estado. Trabalha ao serviço das administrações públicas, gerindo a participação dos seus diferentes órgãos em programas e projetos de cooperação técnica, impulsionando, deste modo, a sua internacionalização.
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Expertise France é a Agência Francesa de Cooperação Técnica Internacional. A sua missão é satisfazer a procura dos países sócios que queiram melhorar a qualidade das suas políticas públicas para responder aos desafios ambientais, sociais, económicos ou de segurança que enfrentam.
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O IILA (Instituto Italo-Latino-americano) é uma organização internacional com sede em Roma, da qual a Itália e as vinte repúblicas latino-americanas são membros. O seu principal objectivo é o desenvolvimento e coordenação de actividades e iniciativas de cooperação entre os membros nos domínios económico, social, cultural e técnico-científico.
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O Camões - Instituto da Cooperação e da Língua, I.P. é um instituto público com autonomia administrativa e financeira. É orientado para a excelência em todos os aspetos relacionados com a coordenação da política exterior portuguesa nos âmbitos da cooperação internacional e da promoção da língua e cultura portuguesas.